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1. chinaXiv:201809.00117 [pdf]

以番茄斑萎病毒核蛋白为靶点的荧光偏振 药物筛选体系的建立及应用

王景丽; 丁真真; 刘辉; 唐延婷
分类: 生物学 >> 生物工程

基于荧光偏振技术建立靶向番茄斑萎病毒(Tomato spotted wilt virus,TSWV)核蛋白(NP)与核酸相互作用的药物筛选体系,并应用该体系展开药物筛选。方法:将目的基因克隆到pGEX-6p-1表达载体上,并采用大肠杆菌表达系统进行目的蛋白的异源表达。建立靶向TSWV NP与核酸相互作用的荧光偏振药物筛选体系,对体系的结合时间、DMSO耐受、变异性和稳定性进行研究,并展开药物筛选。结果:成功构建重组质粒pGEX-6p-1-NP,在大肠杆菌中表达并分离纯化出高质量的核蛋白。基于荧光偏振技术建立了信噪比为8:1,Z因子为0.82的稳定的靶向TSWV NP与核酸相互作用的药物筛选体系,并对化合物库中1000种化合物展开药物筛选,经过初步筛选获得了1种IC50为4.146 μmol/L的化合物。结论:建立了稳定的荧光偏振筛选体系,适用于靶向NP与核酸相互作用的药物的筛选。筛选到的化合物为番茄斑萎病毒的预防和控制提供参考。

提交时间: 2018-09-13 来自合作期刊:《中国生物工程杂志》 点击量240下载量32 评论 0

2. chinaXiv:201809.00118 [pdf]

肠道中多不饱和脂肪酸及其衍生物研究进展

左正三,郭东升,纪晓俊,宋萍,黄和
分类: 生物学 >> 生物工程

肠道菌群是人体微生态学的重要组成部分,也是最大最复杂的微生态系统,在宿主的营养吸收、肠道与免疫系统发育等重要生理过程中发挥作用,与人类健康和疾病密切相关。这些共生微生物排除肠道病原体的功能主要依赖于其产生的生物活性物质,如多不饱和脂肪酸等。同时这些脂肪酸在肠道微生物的作用下能够进一步转化为具有特殊结构和功能的多不饱和脂肪酸衍生物。这些多不饱和脂肪酸衍生物对维持健康稳定的肠道菌群至关重要。此外,多不饱和脂肪酸在宿主防御和免疫中发挥了多重关键作用,包括抗癌、抗炎、抗氧化活性,以及降低肠道致病菌的竞争能力等。本文主要综述了肠道中多不饱和脂肪酸的来源及其重要的生理功能,以及肠道微生物对多不饱和脂肪酸的转化衍生机制;并提出肠道微生物是特殊多不饱和脂肪酸及衍生物生产菌株潜在的种子及基因库,以扩展功能油脂生产菌株的来源。

提交时间: 2018-09-13 来自合作期刊:《中国生物工程杂志》 点击量402下载量37 评论 0

3. chinaXiv:201809.00119 [pdf]

双启动子促进亮氨酸脱氢酶在Bacillus subtilis 中表达及发酵研究

张玲; 王男; 金吕华; 林荣; 杨海麟
分类: 生物学 >> 生物工程

为了促进亮氨酸脱氢酶在Bacillus subtilis中高效表达,采取在质粒pMA5自带的启动子PHpaII之后分别添加诱导型和组成型启动子,考察双启动子对酶表达的影响。选取2种诱导型启动子(Pgrac、Pgl-M1)和4种组成型启动子(P43、Plaps、PHpaII、PamyQ)进行构建表达,其中组成型启动子PamyQ与PHpaII构成的双启动子效果最好,有效地将胞外活性提高到31.24 UmL-1,是单启动子PHpaII的3.4倍。在以上最优双启动子的基础上分别融合Sec途径和Tat途径的4种信号肽,但信号肽与双启动子共同作用并没有获得更高的酶活性。选用酶活最高的双启动子突变菌株Bacillus subtilis 168/pW6(PHpaII-PamyQ)进行7.5 L发酵罐补料发酵产酶研究,LeuDH酶活达到217.96 UmL-1,是摇瓶水平的6.97倍,对工业上产亮氨酸脱氢酶有一定参考价值。

提交时间: 2018-09-13 来自合作期刊:《中国生物工程杂志》 点击量239下载量38 评论 0

4. chinaXiv:201809.00120 [pdf]

新型YdjM超家族成员的钠/氢逆向转运蛋白功能鉴定

王艳红; 刘艳双; 石德喜; 朱保国; 吕保磊; 付诗雨; 徐苗; 王伟; 殷奎德
分类: 生物学 >> 生物工程

在原核生物中,钠/氢逆向转运蛋白具有催化细胞内的Na+、Li+或K+等碱基阳离子的排出,换取外部质子,以降低有毒碱性金属阳离子的细胞质浓度和维持细胞内pH稳态起到了至关重要的作用。为了进一步挖掘中度嗜盐菌Halobacillus Y5中具有盐碱耐受性的钠/氢逆向转运蛋白基因并对其功能进行鉴定,我们首先提取该菌的基因组DNA,然后采用Sau3AI随机酶切及功能互补的方法获得了一个新型的钠/氢逆向转运蛋白基因Ha_ydjM。生物信息学分析表明,该基因属于YdjM超家族成员,是一个未知功能的膜蛋白,系统发育分析证实,其与来自Halobacillus sp. Marseille –P 3789的YdjM(蛋白登录号WP_101846656.1)家族成员聚在一起但形成独立分支。研究发现,该基因能够恢复大肠杆菌突变株KNabc对0.2 M NaCl和5 mm LiCl 的耐受特性,并且耐受碱性pH 8.0。功能分析显示,该蛋白呈现pH依赖的钠/氢逆向转运蛋白活性,转运动力学分析表明,Na+、K+、Li+在KNabc中Km值分别是0.43 ± 0.05 mM、0.49 ± 0.06 mM、0.64 ± 0.06 mM,即对Na+、K+、Li+的亲和力分别是Na+ > K+ > Li+。综上所述,我们认为Ha_ydjM代表了一种新型的钠/氢逆向转运蛋白。该项研究丰富了YdjM超家族成员,并为其他未知膜蛋白功能分析提供依据。

提交时间: 2018-09-13 来自合作期刊:《中国生物工程杂志》 点击量384下载量35 评论 0

5. chinaXiv:201809.00121 [pdf]

敲低ACTL6A通过Notch1信号通路促进早幼粒细胞分化

钟鹏强; 刘北忠; 姚娟娟; 刘冬冬; 袁桢; 刘俊梅; 陈敏; 钟梁
分类: 生物学 >> 生物工程

探讨ACTL6A在人类白血病NB4细胞分化中的作用及其相关机制。我们用ATRA人为诱导NB4细胞分化,Western blotting检测ACTL6A和CD11b的表达水平变化;敲低ACTL6A,通过瑞氏染色观察NB4细胞的形态学改变,Western blotting检测ACTL6A和CD11b的表达水平变化及其相关蛋白的表达水平;敲低同时用ATRA处理NB4细胞,用流式细胞术检测分化标志物CD11b的阳性率;免疫荧光检测ACTL6A在NB4细胞中的空间定位;结果显示NB4经敲低ACTL6A后,CD11b的蛋白水平表达升高;瑞氏染色观察到分化改变;免疫荧光检测到ACTL6A主要分布于细胞核;Western blotting 检测到Notch1,Hes1,Sox2蛋白表达水平明显下调。本研究表明,敲低ACTL6A可以促进人类白血病NB4细胞分化;其机制涉及Notch1信号通路的抑制。

提交时间: 2018-09-13 来自合作期刊:《中国生物工程杂志》 点击量394下载量36 评论 0

6. chinaXiv:201809.00045 [pdf]

An introduction to the main forest vegetation types of mainland SE Asia (Indochina peninsula)

Zhu Hua
分类: 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学

大陆东南亚(印度支那半岛)的植被研究情况鲜为人知, 至今仍无系统研究资料。本文依据数次对该地区的野外考察和资料收集,介绍了东南亚植被的研究情况、文献资料及对该地区主要森林植被的分类及各主要植被类型的特征。大陆东南亚地区在植被分类上包括七个主要的陆生及湿地的森林植被类型:针叶林,针阔混交林,热带山地常绿阔叶林,热带雨林,热带季节性湿润林,热带季风林(季雨林),干旱刺灌丛/萨王纳植被。其中,针叶林植被型包括温性针叶林和热性针叶林二个植被亚型;针阔混交林包括温性针阔混交林和暖温性针阔混交林二个亚型;热带雨林植被型包括热带低地常绿雨林、热带季节性雨林(热带低地半常绿雨林)、热带山地雨林及泥炭沼泽森林四个植被亚型。该文还对大陆东南亚地区植被研究历史、植被分类系统、类型特征及植物区系组成进行了讨论。

提交时间: 2018-09-07 来自合作期刊:《广西植物》 点击量324下载量37 评论 0

7. chinaXiv:201809.00046 [pdf]

缓释砂硒对绿甘蓝富硒作用及生长的影响

张化雨; 徐广平; 庞哲; 张立荣; 马丽霞
分类: 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学

硒是人体必需的微量元素之一,在维持人体正常生理过程和提高人体免疫力方面发挥着重要的作用,人体缺硒会导致多种疾病。无机硒强化剂的人体吸收和利用不太理想,利用植物生长过程中吸收无机硒转化为有机硒则相对安全有效。砂硒因沙子具有透气保水的特性,同时硒释放相对缓慢,能提供稳定的硒来源,是比较理想的富硒蔬果培养基质。为了探讨缓释砂硒对绿甘蓝富硒作用和生长的影响,本研究设置对照组(CK)、实验组(缓释砂硒(CT)、 鸡粪和砂硒 1:1 混合(CT1)、鸡粪和砂硒 1:2 混合(CT2) 和鸡粪(CT3))等 5 个处理。实验结果表明:CT、CT1 和 CT2 处理的绿甘蓝硒含量比 CK 分别增加 45%、61%和64%,逐步回归分析表明绿甘蓝硒含量和土壤硒含量呈显著正相关(P < 0.05);CT2 处理的效果最好,绿甘蓝的产量增加 45%,叶片厚度增加 22.78%,水分利用效率提高 56.66%。土壤锰含量和硒含量共同解释了绿甘蓝生物量变化的 72%,而土壤锌含量解释绿甘蓝水分利用效率变化的 66%。砂硒添加后,通过增加土壤硒含量提高绿甘蓝硒含量,砂硒和鸡粪配比更有效地提高了绿甘蓝硒含量并促进其生长。该研究结果为富硒绿甘蓝的生产提供了一个新思路。

提交时间: 2018-09-07 来自合作期刊:《广西植物》 点击量413下载量43 评论 0

8. chinaXiv:201809.00047 [pdf]

贵州喀斯特山区典型人工林土壤矿质元素特征

喻阳华; 程雯; 杨丹丽
分类: 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学

阐明群落水平上的土壤矿质元素特征,对揭示植物的产量、品质形成机制和养分计量平衡规律具有重要意义,能够科学指导人工林可持续经营。本研究以贵州喀斯特山区典型人工林为研究对象,以金属元素和非金属元素进行类型划分,探讨了土壤矿质元素含量特征及其相关性。结果表明:该区典型人工林土壤矿质元素含量存在较大差异,且同一元素在不同树种之间的变化幅度各异,锌、铬、铁、钛、铝、镁、 镍、钴等的变化规律较为一致,钙、锶等的变化趋势较为相似,砷、硒、硅在桉树(Eucalyptusrobusta) 林、柏木(Cupressusfunebris)林和枇杷(Eriobotryajaponica)林中的含量较高,硫、钠、氯等元素含量 则相反;不同矿质元素随林分类型的变化规律不完全一致,表明植物根系对养分的提取和富集能力存在差异;矿质元素之间表现出一定程度的相关性,存在此消彼长的关系,不同矿质元素之间的相关关系各异,表现出增强或抑制效应,尤其以铁、钙等元素与其他元素的关系更为密切;矿质元素之间的互作效应及其计量平衡关系是分析元素特征的关键,是未来值得深入研究的科学问题。研究结果有利于掌握养分元素积累特征与调控规律,对于该区域典型人工林土壤养分管理具有较强的理论和实践意义。

提交时间: 2018-09-07 来自合作期刊:《广西植物》 点击量414下载量49 评论 0

9. chinaXiv:201809.00048 [pdf]

样品预处理方法对海岸典型沙生植物非结构性碳水化合物含量测定的影响

王松; 杜建会; 秦晶; 张琪; 邵佳怡
分类: 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学

量化植物非结构性碳水化合物(non-structuralcarbohydrate,NSC)含量对研究其生长和适应策略具有重要的意义,但其预处理方法多样,导致不同研究结果之间可比性较差。该文以华南海岸典型沙生植物木麻黄、老鼠艻、海马齿和厚藤为例,研究苯酚-浓硫酸法测定 过程中,是否去皮和过筛目数大小对其 NSC 及组分含量测定的影响。结果表明:(1)不同 龄级木麻黄样品去皮后提取的 NSC、可溶性糖和淀粉含量均出现下降趋势,与对照相比, 幼龄林和中龄林样品可溶性糖含量下降达到显著程度(P<0.05),而淀粉含量差异不显著, 成龄林样品 NSC 及其组分含量差异均不显著。龄级越小,去皮预处理对树木 NSC 及其组分 提取影响越大,尤其以可溶性糖影响最为明显,建议乔木处理时统一保留树皮。(2)不同 沙生植物枝(茎)样品提取的 NSC 及其组分含量随过筛目数增大总体呈增加趋势,且木麻 黄和老鼠艻枝(茎)过筛 100 目相对 18 目提取的 NSC 含量均达到显著水平(P<0.05), 而叶(同化枝)样品除老鼠艻外均变化不显著。(3)沙生植物器官机械组织含量越高,不 同过筛目数提取的 NSC 及其组分含量差异越大,综合考虑样品获取难度及 NSC 含量的测定 精度,建议所有沙生植物枝叶样品均过 100 目筛。

提交时间: 2018-09-07 来自合作期刊:《广西植物》 点击量249下载量41 评论 0

10. chinaXiv:201809.00049 [pdf]

苹果蓟属,东南亚大陆菊科一新归化属

沈佳豪; 牛帼豪; 张国进; 付志玺; INTA Angkhana; 高天刚
分类: 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学

报道了在泰国北部和中国东南部的菊科一个新归化属——苹果蓟属(Centratherum Cass.)。依据所采集的标本,详细描述了该属在东南亚大陆的唯一代表亚种苹果蓟 [Centratherum punctatum Cass. subsp. fruticosum (S. Vidal) K. Kirkman ex Shih H. Chen, M. J. Wu & S. M. Li]并配以插图。苹果蓟与其所在属的其它物种之区别在于该亚种叶片菱形至椭圆形, 叶缘具不规则锯齿,先端微尖,总苞片基部硬化,先端无芒。文中提供了苹果蓟的分布图, 并讨论了其可能的传播途径。

提交时间: 2018-09-07 来自合作期刊:《广西植物》 点击量235下载量38 评论 0

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