欧耧斗菜 AP2/ERF 基因家族鉴定及盐胁迫下表达分析

分类： 生物学 >> 植物学 提交时间： 2022-12-29 合作期刊: 《广西植物》

王玉凤 孟缘 于海航 崔丁元 白云

摘要： AP2/ERF 转录因子在植物生长发育和响应非生物胁迫中发挥着重要的作用。为探 究欧耧斗菜（Aquilegia vulgaris）中 AP2/ERF 对盐胁迫的响应，该研究基于前期试验获得的 盐胁迫下转录组数据，通过生物信息学方法筛选欧耧斗菜 AP2/ERF 家族基因，分析其生化 特征、保守基序、系统进化等，并对其在盐胁迫处理不同时间的根与叶中的表达量变化进行 分析，利用qRT-PCR 技术对候选基因表达量进行验证。结果表明：（1）筛选出86 个AvAP2/ERF 基因，其编码的蛋白质为 154~722 aa，相对分子量为 14 763.3~79 069.47 Da，等电点介于 4.49~9.68 之间，偏酸性蛋白较多，均为亲水性蛋白；对 AvAP2/ERF 蛋白进行亚细胞定位预 测，大多数定位于细胞核。（2）二级结构以无规则卷曲和-螺旋为主，均具有 AP2 保守结 构域，有两个高度保守的基序 Motif 1 和 Motif 2。（3）在盐胁迫下，71 个 AvAP2/ERF 基因 表达量发生变化，其中叶片中差异表达基因 18 个，根中 19 个；欧耧斗菜与拟南芥 AP2/ERF 基因聚类为 5 个亚家族，15 个亚组，通过表达分析及同源关系，确定 3 个响应盐胁迫的基 因 AvAP2/ERF-56、AvAP2/ERF-61 与 AvAP2/ERF-80，其 qRT-PCR 结果与转录组数据一致。 该研究为深入探究欧耧斗菜 AP2/ERF 基因的功能及逆境响应机制奠定了基础。

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