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  • 荔枝(Litchi chinesis Sonn.)果实酸性转化酶LcSAI 生物信息学和表达分析

    分类: 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间: 2020-01-12 合作期刊: 《广西植物》

    摘要: 酸性转化酶作为蔗糖代谢中的关键酶,在还原糖积累型荔枝中表达及酶活性显著高于蔗糖积累型荔枝。为了全面了解酸性转化酶的生物学特征,本研究通过运用生物信息学方法对荔枝果实酸性转化酶LcSAI 基本的理化性质、蛋白二级结构、亲水性/疏水性、跨膜结构域、信号肽、磷酸化位点、保守结构域、系统进化进行系统的分析;利用qRT-PCR 技术对LcSAI 在妃子笑不同组织和果实不同发育阶段进行表达分析。结果表明:荔枝果实酸性转化酶为定位于液泡的亲水性不稳定蛋白,无信号肽,其蛋白的二级结构主要有无规则卷曲和延伸链构件,并散布于整个蛋白;在N-端含有一个跨膜区,包含两个保守结构域,位于N-端的Pfam DUF3357 结构域和Glyco_32 结构域,属于糖基水解酶基因家族32超家族;系统进化表明与龙眼酸性转化酶基因同源,不同组织间LcSAI 表达水平为雄花>根>嫩茎>种子>嫩叶>雌花>果皮>老叶,果实不同发育阶段LcSAI 表达具有特异性。本研究为深入研究LcSAI 果实酸性转化酶基因调控蔗糖代谢途径机理提供数据依据。

  • XTH基因家族在妃子笑荔枝花穗不同处理方式的表达分析

    分类: 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间: 2019-08-26 合作期刊: 《广西植物》

    摘要: 木葡聚糖内切葡聚糖酶/水解酶(xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase,XTH)是一类重要的糖苷水解酶,在促进植物细胞壁延展以及响应逆境胁迫方面发挥着重要的作用。为了研究荔枝XTH家族基因在不同花穗处理方式下的表达情况,本研究以妃子笑荔枝为实验材料,对妃子笑花穗进行疏花和喷施烯效唑处理;基于前期转录组数据库鉴定出29个LcXTH家族成员,利用荧光定量PCR(qRT-PCR)技术对LcXTH基因家族成员在不同处理后花穗的表达进行研究,分析XTH家族基因对不同花穗处理方式的响应情况。结果表明:LcXTH家族基因成员表达在对照、疏花处理和烯效唑处理后花穗不同发育阶段表达规律不同,且不同基因存在表达量的差异。其中LcXTH 亚家族III、LcXTH 亚家族IV(LcXTH2、LcXTH3、LcXTH4、LcXTH5、LcXTH6、LcXTH7、LcXTH9、LcXTH10、LcXTH11、LcXTH12、LcXTH13、LcXTH22和LcXTH23)成员及LcXTH20表达量较高,推测在花穗发育中起关键作用。妃子笑花穗疏花处理14d后LcXTH家族大部分成员表达上调,推测疏花对LcXTH的表达起到正调控作用;妃子笑花穗喷施烯效唑后LcXTH家族成员的表达下调,推测烯效唑处理对LcXTH的表达起到负调控作用。