分类： 生物学 >> 生物化学 分类： 生物学 >> 分子生物学 提交时间： 2024-01-25
摘要： 目的：通过分析小鼠自主食用不同甜味物质后尿液蛋白质组的变化，探索其对机体的可能影响。方法：收集C57BL/6l小鼠主动食用甜味物质前后的尿液样品。甜味物质包括目前世界范围内应用较为广泛且能引起小鼠喜好反应的蔗糖、甜菊糖苷、安赛蜜、三氯蔗糖，其中非营养性甜味剂的浓度选择了已有研究显示的小鼠喜好反应最强烈的浓度。通过高效液相色谱串联质谱联用（LC-MS/MS）的非标记定量蛋白质组学技术进行分析，成组筛选尿液蛋白质组的差异蛋白，进行蛋白质功能和生物学过程分析；进行单只小鼠食用甜味物质前后尿液蛋白质组比较；并将不同甜味物质进行横向对比。结果及结论：尿液蛋白质组可以反映小鼠自主食用甜味物质后的机体变化，且小鼠自主食用的不同甜味物质对尿液蛋白质组的影响并不相同。4种甜味物质中，三氯蔗糖与蔗糖引起机体的变化最为相似，甜菊糖苷与蔗糖引起机体的变化相差最远；蔗糖、安赛蜜和三氯蔗糖引起的机体变化相似，而甜菊糖苷引起机体的变化与其他甜味物质不同。小鼠自主食用4种甜味物质后尿液蛋白质组差异蛋白中均有已经被报道的与脑奖励回路相关的蛋白，而只有自主食用蔗糖、安赛蜜和三氯蔗糖后尿液蛋白质组差异蛋白大量与代谢过程相关，自主食用甜菊糖苷后尿液蛋白质组差异蛋白主要与核小体组装、基因表达等过程相关。
分类： 生物学 >> 生物化学 分类： 生物学 >> 分子生物学 提交时间： 2024-01-02
摘要： 目的：对肥胖人群与正常人群尿液蛋白质组的比较。方法：收集肥胖人群和正常人群的尿液样品，通过高效液相色谱串联质谱联用（LC-MS/MS）的非标记定量蛋白质组学技术进行鉴定。筛选肥胖人群与正常人群尿液蛋白质组的差异蛋白进行蛋白质功能和生物学通路分析；将肥胖个人与正常人群尿液蛋白质组进行比较，统计共有差异蛋白进行蛋白质功能和生物学通路分析；在肥胖个人尿液蛋白质组中检索已被报道的肥胖生物标志物。结果：肥胖人群相对于正常人群尿液蛋白质组可鉴定到38个差异蛋白，其中有些蛋白已经被报道与代谢、肥胖相关，差异蛋白富集到的生物学过程也与代谢等过程相关；肥胖个人与正常人群尿液蛋白质组比较富集到８个共有差异蛋白，其中有蛋白已经被报道与代谢、肥胖相关，差异蛋白富集到的生物学过程也与代谢等过程相关；在肥胖个人相对于正常人群尿液蛋白质组的差异蛋白中，能匹配到已被报道的肥胖生物标志物。结论：尿液蛋白质组能进行正常人与肥胖者的区分，尿液蛋白质组差异蛋白中具有已知和肥胖、代谢相关的关键蛋白，且差异蛋白能富集到营养、代谢等相关生物学过程。尿液蛋白质组具有探究肥胖发生机制、提供个性化治疗的潜力。
分类： 生物学 >> 生物化学 分类： 生物学 >> 分子生物学 提交时间： 2023-11-16
摘要： 目的：比较雄性大鼠交配行为后前两天尿液蛋白质组变化。方法：收集Sprague-Dawley大鼠交配当天的尿液样品和交配隔天的尿液样品，通过高效液相色谱串联质谱联用（LC-MS/MS）的非标记定量蛋白质组学技术进行分析，筛选尿液蛋白质组的差异蛋白（FC＞1.5 或＜0.67，P<0.050）进行蛋白质功能和生物学通路分析。结果：大鼠交配隔天与交配当天尿液蛋白质组比较可以鉴定到43个差异蛋白。通过Uniprot数据库和Pubmed数据库检索差异蛋白和相关文献报道，近三分之二的差异蛋白与精子发生相关。结论：大鼠交配隔天相较于大鼠交配当天，尿液蛋白质组就发生了变化，部分变化蛋白的已知功能与精子发生相关。
分类： 生物学 >> 分子生物学 提交时间： 2023-05-05
摘要： 尿蛋白质组能反映动物机体多么短期的生长发育变化？在进行使用生长较为快速时期的动物建造模型的尿液标志物研究时，是否需要考虑短期发育对尿蛋白的影响？本研究通过对10只6-8周龄的Wistar大鼠相隔3天、6天的尿液样本进行采集，并使用高效液相色谱串联质谱联用（LC-MS/MS）的非标记定量蛋白质组学技术对样本进行分析。结果表明，尿液蛋白质组可以敏感地将大鼠短期生长发育的机体变化反映出来。其中，将Day0和Day6的尿蛋白质组相比较，经过筛选（FC1.5或0.67，P
分类： 生物学 >> 分子生物学 提交时间： 2020-02-20
摘要： 新冠病毒是病毒感染性肺炎（COVID-19）的病原体。然而，新冠病毒核酸临床检出的假阴性率很高。假阴性意味着漏检，不仅会导致疑似患者不能快速确诊，而且会使漏检者成为潜在的病毒传染源。因此，提高新冠病毒核酸检出率十分迫切。目前国家卫健委相关指南要求在提取样本核酸前需将样本置于56℃以上以灭活病毒。这一灭活过程无疑是保护临检人员免受病毒暴露所必需，但也会破坏病毒核酸的完整性，导致部分样品不能被正常检出，成为高假阴性率的原因之一。最近，我们以猪PDEV冠状病毒（疫苗）作为模型研究了高温灭活过程对病毒核酸完整性的影响。结果表明：保存在常用等渗盐溶液Hank’s液中的样品经56℃孵育30分钟后可检出冠状病毒核酸损坏了一半，而以92℃孵育5分钟，则可检出的冠状病毒核酸损失了96%以上。当采用一款市售的R503样品保存液保存PEDV时，经56℃孵育30分钟后病毒核酸可检出量是Hank’s液的3倍，若是92℃孵育5分钟，则可检出量是Hank’s液的42倍。这些结果提示，使用可有效保护样本RNA特别是避免样本RNA在高温灭活时受损的样品保存液，不但可以让临检人员依然能够在高温灭活后使用样品，还有望提高阳性检出率。
分类： 生物学 >> 分子生物学 提交时间： 2018-12-10
摘要： 探索和理解蛋白质折叠问题一直是分子生物学的挑战。未折叠的蛋白质应该存在一种普遍初始热力学亚稳态，否则无法解释蛋白质是如何在剧烈的热振动干扰下完成精确折叠的。文章通过分析水溶液环境和蛋白质折叠的相关性，揭示了一种由水分子屏蔽效应引起的未折叠蛋白质的普遍初始热力学亚稳态，该亚稳态的存在是环境中水分子的物理性质决定的并被认为是蛋白质正确折叠的必要条件。我们通过研究已发表的实验数据和建立分子模型，找到了该普遍初始热力学亚稳态存在的相关证据，通过理论分析初步探索了该热力学亚稳态导致蛋白质精确折叠的相关物理机制。
分类： 生物学 >> 分子生物学 提交时间： 2018-08-29
摘要： 受互补回文小RNA发现的启发, 本研究从小RNA水平考虑DNA互补回文模式的生物学功能，并揭示了非洲猪瘟病毒基因组中较长（14 bp以上）DNA互补回文模式的分布特征. 本研究中公开的非洲猪瘟病毒基因组中的DNA互补回文模式可以用于设计引物或探针, 提高病毒检测的灵敏度和特异度；也可以直接用于设计小干扰RNA（small interfering RNA, siRNA）进行RNA干扰实验. 这样, 不需要病毒感染，更多的基础研究工作者可以使用这种间接方法研究非洲猪瘟病毒感染和致病机制. 本研究提供的研究病毒基因组中DNA互补回文模式的思路和方法，可以推广到其他微生物或动植物基因功能或进化研究领域, 具有重要的理论意义.
分类： 生物学 >> 分子生物学 提交时间： 2018-05-14 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 松萝酸是地衣中分布最广泛，含量最丰富的地衣酸之一，因早期作为抗生素而闻名于世。近20年来，有关松萝酸在抗菌、抗病毒、抗肿瘤等方面的活性作用机理不断有新的突破。研究揭示松萝酸主要通过影响细菌生物膜的形成、抑制细菌及病毒RNA和DNA的合成从而达到抑制细菌和病毒的目的，通过诱导肿瘤细胞程序性凋亡及抑制肿瘤细胞DNA的合成等途径，达到杀死肿瘤细胞的效果，并且松萝酸还具有抑制肿瘤细胞迁移的能力。但与此同时，松萝酸作为减肥营养补充剂而引发肝细胞线粒体功能障碍，进而导致肝脏损伤的作用也日益受到了科学界的关注。为更好的把握松萝酸资源研究开发的方向，本文对近20年来松萝酸在抗菌、抗病毒、抗肿瘤等活性方面的作用机理及肝脏毒方面的研究进行了归纳分析。截至目前，松萝酸在隶属于35个属的种里被报道有分布，其中大多数是枝状地衣，其次为叶状地衣，壳状地衣只有个别种里有。该文也对目前已报道的含有松萝酸的属种及有关影响松萝酸含量的环境因子的研究进行了全面的梳理，以期为富含松萝酸的优良种质资源的发掘和开展后续活性作用研究需要面对的松萝酸种质资源问题提供理论帮助。
分类： 生物学 >> 分子生物学 提交时间： 2018-05-07 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 物种遗传多样性与其适应能力和进化潜力密切相关，了解珍稀濒危植物遗传多样性和遗传结构可以为其保护策略与管理方式的制定提供理论基础。薄叶金花茶、小花金花茶和小瓣金花茶是三种濒危金花茶植物，本研究利用微卫星标记对它们的7个种群共184个个体进行遗传多样性和遗传结构分析。11个位点共检测到等位基因92个。在物种水平上，小瓣金花茶平均等位基因数（NA）为3.9、有效等位基因数（NE）为2.328、观测杂合度（Ho）为0.520、期望杂合度（He）为0.501，高于薄叶金花茶和小花金花茶。在种群水平上，有效等位基因数（NE）在1.788～2.466之间，期望杂合度（He）在0.379～0.543之间；种群间遗传分化系数（FST）在0.143 7～0.453 3之间，种群间基因流（Nm）在0.301 5～1.488 9之间。AMOVA 分子变异分析显示65.72%的变异存在于种群内。三种金花茶具有较低水平的遗传多样性和高水平的种群间遗传分化。STRUCTURE和PCoA种群遗传结构分析结果将取样种群分为2组，即薄叶金花茶和小花金花茶大部分个体分为一组，小瓣金花茶大部分个体分为一组。现存所有种群应根据实际情况尽快采取就地保护或迁地保护措施。
分类： 生物学 >> 分子生物学 分类： 生物学 >> 神经生物学 分类： 生物学 >> 生物工程 分类： 物理学 >> 电磁学、光学、声学、传热、经典力学和流体动力学 提交时间： 2017-02-04
摘要： 是一种基于经颅磁电刺激技术有效治疗帕金森病、阿尔茨海默病的新观点，可理解成电压门控钙离子通道物理激活最佳靶点假说，基本内容：帕金森病、阿尔茨海默病等神经元退行性变疾病，与物理门控离子通道密切相关，可用物理手段来解决，激活递质能神经元是治疗的关键，电压门控钙离子通道则是物理手段激活的最佳靶点，目的是诱导钙离子内流触发神经元轴突终末突触囊泡释放神经递质。脑细胞激活论，指出了阿尔茨海默病、帕金森病等神经元退行性变疾病的治疗原则、方法与目的，提示了试图通过药物化学手段来寻求神经元退行性变疾病的解决办法，可能会动摇我们应对疾病的信心，而物理手段的应用或物理化学手段的联合应用也许是我们今后应对一些重大脑病的主要科研方向。
分类： 生物学 >> 细胞生物学 分类： 生物学 >> 神经生物学 分类： 生物学 >> 分子生物学 分类： 物理学 >> 电磁学、光学、声学、传热、经典力学和流体动力学 提交时间： 2017-01-20
摘要： This is a new idea that based on effective treatment of Parkinson's disease and Alzheimer's disease with transcranial magnetoelectric stimulation technology, it can understand a hypothesis about voltage-gated Ca2+ channels is the best target for activation by physical means, basic content：Parkinson's disease , Alzheimer's disease etc. neuronal degeneration diseases, that closely related to physical-gated ion channels, which can be treated with physical means, activating neurotransmitters-energic neurons plays key roles in the treatment, and voltage-gated Ca2+ channels is the best target for physical means, the purpose is to induce Ca2+ inflowing and triggers neuronal axon terminals synaptic vesicles releasing neurotransmitters. The theory of brain cell activation sets forth the principle, method and purpose of treatment of the physical gated ion channel diseases such as Alzheimer's disease, Parkinson's disease and other neural degeneration diseases, and indicates that the attempt to treat these diseases using pharmaceutical and chemical approaches could shake our confidence in conquering the diseases, and the application of physical approaches or combined application of physical and chemical approaches in the treatment of some major encephalopathy may be our main research direction in the future.
分类： 生物学 >> 分子生物学 分类： 生物学 >> 动物学 提交时间： 2016-10-06
摘要： In this study, we introduced a general framework to use PacBio full-length transcriptome sequencing for the investigation of the fundamental problems in mitochondrial biology, e.g. genome arrangement, heteroplasmy, RNA processing and the regulation of transcription or replication. As a result, we produced the first full-length human mitochondrial transcriptome from the MCF7 cell line based on the PacBio platform and characterized the human mitochondrial transcriptome with more comprehensive and accurate information. The most important finding is two novel genes hsa-MDL1 and hsa-MDL1AS, which are encoded by the mitochondrial D-loop regions. We propose hsa-MDL1 and hsa-MDL1AS, as the precursors of transcription initiation RNAs (tiRNAs), belong to a novel class of long non-coding RNAs (lnRNAs), which is named as long tiRNAs (ltiRNAs). Based on the mitochondrial RNA processing model, the primary tiRNAs, precursors and mature tiRNAs could be discovered to completely reveal tiRNAs from their origins to functions. The ltiRNA/tiRNA system and their regulation mechanisms could exist ubiquitously in eukaryotes and prokaryotes. These findings will enrich the basic concepts in the field of mitochondrial biology, lnRNA functions and regulation of gene expression.
分类： 生物学 >> 分子生物学 提交时间： 2016-06-16
摘要： 铁硫簇蛋白是一类重要的线粒体功能蛋白，在细胞能量代谢、电子传递、底物结合与激活、铁/硫存储、酶促反应、基因表达调控等诸多过程中均发挥了关键作用. 一旦铁硫簇组装及转运过程发生障碍，必将严重影响细胞内铁的稳态及铁硫蛋白的功能. 其中，分子量约 11-kDa 的 IscA，是铁硫蛋白亚家族 hesB 之一的高保守性成员，能结合铁离子及[2Fe-2S]簇，从而参与铁硫簇蛋白的合成，因此在铁硫簇组装蛋白系统中具有重要的作用. 更值得关注的是，2015 年谢灿和张生家各自研究组分别发现了 IscA1 具有独特的磁感应(magnetic sensor，MagS)与磁受体(magnetic receptor，MagR)功能. 尤为重要的是，通过外磁场刺激相关磁基因表达，能够调控神经活动及行为定位. 鉴于磁受体的独特功能并结合相关技术，遂将其统称为磁遗传学(磁基因学). 本文简要介绍 IscA 蛋白的始初发现与鉴定历程、进化保守性及其独特的生理生物学功能，并凝练出磁遗传假说机制调控模型.
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