摘要: 为探究 CesA 基因家族在白菜生长发育及纤维素合成过程中的作用机制,该研究通过
生物信息学的方法,以白菜的全基因组序列为研究区域,进行了理化特征、基因结构、进化
特征、保守基序及结构域、顺式作用元件和组织表达等鉴定分析。结果表明:(1)白菜基因
组中鉴定出 16 个编码纤维素合成酶亚基的 CesA 基因,该家族成员所编码蛋白的理论等电
点介于 4.76~9.12,相对分子量 17.76~122.67 kD,长度 153~1 089 aa;(2)其中 15 个基因
不均匀地分布于白菜的 7 条染色体上,Bra036008 定位于 scaffold 上;(3)大部分成员包含
4-14 个外显子,1-11 个保守基序;(4)序列比对显示该家族具有保守的DDD-QXXRW 保
守功能域;(5)该家族编码蛋白主要分布在质膜上,二级结构以无规则卷曲与α-螺旋为主,
多数成员都含有CesA 蛋白典型的N 端、C 端和跨膜区;(6)CesA 基因在茎中表达量相对
较高,其中Bra011865、Bra023952 和Bra029874 在茎、叶、花中显著表达。该研究利用生
物信息学方法对白菜CesA 基因家族进行了全基因组鉴定,为后续深入研究CesA 基因功能
奠定了基础,也为白菜生长发育研究奠定基础。