基于二代测序数据的尖吻蝮基因组的组装与注释

Genome assembly and annotation of the Sharp-nosed Pit Viper Deinagkistrodon acutus based on next-generation sequencing data

作者： 王心雨 ^1,2,3 刘力榕 ² 朱文标 ² 汪诗晴 ^1,4 施敏辉 ^1,4 杨淑慧 ³ 卢浩荣 ² 曹军 ²
作者单位：

1. 农业基因组学国家重点实验室，深圳华大生命科学研究院

2. 深圳国家基因库

3. 野生动物与自然保护地学院，东北林业大学

4. 生命科学学院，中国科学院大学
通讯作者： 王心雨 Email:wxyqwe456@163.com
提交时间：2023-08-11 10:21:07

摘要: 对目前已知3,000余种蛇类的研究可为它们的基因组进化提供有价值的见解。尖吻蝮，也被称为尖鼻蝮、百步蛇或五步蛇，是一种具有重要经济、医学和科学价值的毒蛇。其广泛分布于中国东南部和东南亚，主要用于蛇毒研究。本文采用二代测序技术，组装和注释了一个高度连续的尖吻蝮基因组。基因组大小为1.46 Gb; 其scaffold N50长度为6.21 Mb，重复序列含量为42.81%，共注释出24,402个功能基因。本研究有助于在遗传水平上进一步认识和利用尖吻蝮及其毒液。

遗传学与基因组学动物遗传学进化生物学

来自： 王心雨
分类： 生物学 >> 动物学
投稿状态： 已投稿期刊
引用： ChinaXiv:202308.00139 (或此版本 ChinaXiv:202308.00139V1)
DOI:10.12074/202308.00139V1
CSTR:32003.36.ChinaXiv.202308.00139.V1
推荐引用方式： 王心雨,刘力榕,朱文标,汪诗晴,施敏辉,杨淑慧,卢浩荣,曹军.(2023).基于二代测序数据的尖吻蝮基因组的组装与注释.中国科学院科技论文预发布平台.[ChinaXiv:202308.00139] (点此复制)

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2023-08-11 10:21:07

ChinaXiv:202308.00139V1

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